菌類の分類体系
| 担子菌門 | ー | ー | （約３００００種） |
| ー | 菌じん綱 | ハラタケ目、 | ヒダナシタケ目 |
| ー | 腹菌綱 | キクラゲなど | ー |
| ー | 異担子菌綱 | ー | ー |
| ー | サビ菌綱 | ー | ー |
|---|---|---|---|
| ー | クロボキン綱 | ー | ー |
| 子嚢菌門 | ー | ー | （約３３０００種） |
| ー | 半子嚢菌綱 | ー | ー |
| ー | 不整子嚢菌綱 | ー | ー |
| ー | 核菌綱 | ー | ー |
| ー | 盤菌綱 | チャワンタケなど | ー |
| ー | 小房子嚢菌綱 | ー | ー |
| （不完全菌門） | ー | ー | （約１４０００種） |
| ー | 糸状不完全菌類 | ー | ー |
| ー | 分生子果不完全菌類 | ー | ー |
| 接合菌門 | ー | ー | （約１０００種） |
| ー | 接合菌綱 | ケカビなど | ー |
| ー | トリコミケス綱 | ー | ー |
| ツボカビ門 | ー | （胞子に１本の鞭毛） | （約９００種） |
| 卵菌門 | ー | ミズカビ、ツユカビ等 | （約８００種） |
| 変形菌門 | ー | ー | （約９００種） |
| 原生粘菌門 | ー | ツノホコリなど | （約３５種） |
| 細胞性粘菌門 | ー | タマホコリなど | （４６種） |
| ネコブカビ門 | ー | 球嚢菌など | （４７種） |
| アクラシア門 | ー | ー | （１２種） |
| ラビリンチュラ門 | ー | ー | （４８種） |
最新の分類体系については英国のCABIより公開されている
（URL http//www.indexfungorum.org./Names/Names.asp)
を参照して下さい
（神奈川県立生命の星・地球博物館｢身近な菌類の観察」による）
（注）納豆菌、乳酸菌は細菌類なので菌類にはいれません